В июне 1942 года был призван в Красную Армию. В то время работал в Горном улусе Бердьигэстэхской средней школе военруком. 1942-1943 годы воевал на северо-западном фронте, на Орловско-Курском направлении, в 1944 г. во II Белорусском, в 1945 г. в III Белорусском фронтах. С 5 июля по 8 сентября 1943 г. будучи младшим командиром в 856-й стрелковой пехоте на Орловско-Курском направлении храбро сражался в кровопролитных боях на передовой. Много раз поднимались на атаку под призыв «За Родину, за Сталина!». Третий батальон под командованием Алексея Пестерева на берегу реки Ока попал в окружение противников. С неимоверным трудом, неся большие потери, батальон вырвался из окружения. В рукопашном бою под Орлом из 12 бойцов их отделения остались в живых трое. Пополненный третий раз полк вступил в бой по направлению города Брянска, в котором Пестерев был тяжело ранен. В мае 1944 года закончил 2 месячные курсы связистов под Москвой. Служил в 89-м Верхнеднепровском, гвардейском, минометном полку связист-телефонистом. В 1944 году их полк участвовал в освобождении Могилева, Минска, Польши. В феврале 1945 году перешли границу Германии. Полностью освободили Восточную Пруссию. 3 апреля освободили промышленный портовой город Данциг. 16 апреля 1945 года возле Балтийского моря был тяжело ранен. 13 месяцев лежал в госпитале, вернулся домой в Чурапчинский район инвалидом войны II группы. С 1948 года член ССКП. Работал воспитателем Тюнгюлюнском профтехучилище.